Phường Yên Tử được thành lập theo Nghị quyết số
1679/NQ-UBTVQH15
ngày 16/6/2025 của Uỷ ban Thường vụ Quốc hội
khoá XV về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã của tỉnh Quảng Ninh
năm 2025 trên cơ sở sắp xếp toàn bộ diện tích tự nhiên, quy mô dân số của
phường Phương Đông, Phương Nam và xã
Thượng Yên Công.
Phường có quy mô rộng, kết nối không gian đô thị, du lịch và sinh thái
của khu vực Yên Tử; đồng thời là đầu mối quan trọng trong định hướng
phát triển dịch vụ, văn hoá và đời sống dân cư trên địa bàn.